Isojoki on yksi maamme viidestä jäljellä olevasta joesta, jossa yhä on oma elinvoimainen meritaimenkanta. Arvokkaan meritaimenkannan takia joki kuuluu UNESCOn:n hyväksymiin kansainväisiin ns. Project Aqua- vesistönsuojelukohteisiin. Jokialue on kalastoltaan Pohjanmaan monipuolisin jokivesistö ja merkittävin lähes vapaana virtaava, Selkämereen laskeva jokivesistö. Se kuuluu myös Natura 2000 alueeseen.
Lapväärtin-Isojoen pääuoma saa alkunsa Länsi-Suomen korkeimmalla paikalla 231 m merenpinnan yläpuolella sijaitsevalta Lauhanvuorelta. Lapväärtin-Isojoki laskee Selkämereen noin 10 km Kristiinankaupungin eteläpuolella.
Lapväärtin-Isojoki on yläjuoksultaan hyvin kapea ja muistuttaa paikoitellen puroa. Vanhankylän yläpuolella on runsaasti meandereita ja jokialue on laaksomaista. Täällä vedenpinta on peltomaita huomattavasti alempana. Joki on melko kapea ja jokitörmien pensasto ja puusto on tiheää. Itse jokiuoma ranta-alueineen muodostaa paikka paikoin muusta maisemasta erottuvan kokonaisuuden. (lähde: Jokamiehen vesiensuojeluohje Lapväärtin - Isojoelle)
Joessa esiintyy kaksikymmentäviisi kalalajia sekä joki- ja puronahkiaisia. Joessa elää erittäin uhanalainen alkuperäinen meritaimenkanta sekä purotaimenia. Jokiosuudella on myös hyvä luontainen harjuskanta ja alajuoksulle nousee vaellussiikaa.
Isojoen kirkonkylän jokiosuudesta odotetaan mielenkiintoista vapaa-ajan kalastajien kohdetta. Isojoen -Lapväärtin joki on yksi harvoja Etelän jokia, sekä Selkämeren ainoa, jossa taimen nousee luontaisesti kutemaan jokeen. Luontaisen taimenen nousun latvavesistöön on aiemmin estänyt Villamon kalanviljelylaitoksen pato. Nyt pato on purettu ELY-keskuksen projektin ansiosta ja samalla taimenen luontainen nousu latvavesille on turvattu. Padon poisto mahdollistaa isojakin tärppejä vapaa-ajan kalastajille jatkossa myös kirkonkylän jokiosuudella. Luontaisen taimenen nousun lisäksi kirkonkylän jokiosuudelle on istutettu runsaasti taimenta viime vuosien aikana.
2019: Meritaimen (ISO) 670 kpl K-paino 74 g
2017: Meritaimen (ISO) 3 600 kpl 1 v K-paino 12,5 g
2017: Meritaimen (ISO) 6 000 kpl 1 v K-paino 12,5 g (Koppelonkylä)
2017: Meritaimen (ISO) 6 000 kpl 1 v K-paino 12,5 g (Iivarinkylä)
2017: Meritaimen (ISO) 1 848 kpl 2 v K-pituus 24,4 mm K-paino 128,5 g
2017: Meritaimen (ISO) 5 285 kpl 1 v K-paino 22 g
2016: Meritaimen (ISO) 3 115 kpl 2 v K-pituus 23,8 mm K-paino 122 g
2015: Meritaimen (ISO) 1 968 kpl 2 v K-pituus 23,8 mm K-paino 122 g
26.03.2015: 35 000 - 37 500 kpl (5 litraa) Silmäpussikoon mätiä
12.02.2015: 7000 - 7500 kpl Silmöpussikoon mätiä
25.04.2014: 6000 kpl Ruskopussi-vaiheisia taimenia, jokiveden lämpötila 5°
08.05.2013: 2000 kpl Ruskopussi-vaiheisia taimenia, jokiveden lämpotila 9°
21.02.2012: 7000 - 7500 kpl Silmäpussikoon mätiä, jokiveden lämpotila 0,2 - 0,3°
11.04.2011: 2500 - 3000 kpl Silmäpussikoon mätiä
24.03.2010: 2000 kpl Ruskopussi-vaiheisia, jokiveden lämpotila 0,2 - 0,3°
Lisätietoja
Etelä-Pohjanmaan ELY-keskuksen blogi: #lapvaartin-isojoki
Isojoen taimenten radiotelemetriaseuranta 2019–2021 : Taimenten vaelluskäyttäytyminen, levittäytyminen ja kutualueiden sijainti
Freshabit Life IP – Pohjanmaat joet osahankkeeseen kuuluu Lapväärtin-Isojoki, Karvianjoen ja Lapväärtin-Isojoen latva-alueet sekä Ähtävänjoki. Hanke ajoittui vuosille 2016–2022, ja sitä koordinoi Metsähallituksen Luontopalvelut.